SHAEO

GIST

ケモインフォマティクス

Grid Inhomogeneous Solvation Theory (GIST) による水解析【OpenMM/AmberTools】

オープンソースソフトウェアを用いて「Grid Inhomogeneous Solvation Theory (GIST)」による水解析を実施します。本記事では、OpenMM と AmberTools を用いて GIST 解析を実施し、タンパク質ポケット中の水の安定性を評価する手順を紹介します。
2026.01.12
ケモインフォマティクス

自己紹介

OSS環境構築職人
shaeo
shaeo

シンプルにAIが好き。技術に浸りたい。

shaeoをフォローする

最近の投稿

  • Grid Inhomogeneous Solvation Theory (GIST) による水解析【OpenMM/AmberTools】
  • リガンド-タンパク質の相互作用を考慮した分子生成モデル【DiffPharma】
  • ドッキングシミュレーション及び結合自由エネルギー評価【Gypsum-DL/GNINA/Uni-GBSA】
  • 事前学習モデルを利用した物性予測【CheMeleon/Chemprop】
  • MMPA用のオープンソースWebアプリケーション【Matcher】

最近のコメント

表示できるコメントはありません。

アーカイブ

  • 2026年1月
  • 2025年11月
  • 2025年10月
  • 2025年9月
  • 2025年8月
  • 2025年4月
  • 2025年2月

カテゴリー

  • ケモインフォマティクス
  • 環境構築
SHAEO
Copyright © 2025 SHAEO All Rights Reserved.
  • ホーム
  • トップ