ケモインフォマティクス ドッキングシミュレーション及び結合自由エネルギー評価【Gypsum-DL/GNINA/Uni-GBSA】
リガンド三次元化に「Gypsum-DL」、ドッキングに「GNINA」、自由エネルギー評価に「Uni-GBSA」を用いることで、オープンソースツールのみで再現可能なSBDDスコアリングパイプラインを構築します。
2025-10
ケモインフォマティクス 
ケモインフォマティクス 事前学習モデルを利用した物性予測【CheMeleon/Chemprop】
事前学習モデルとして「CheMeleon」を利用し、物性予測モデルの構築/評価を行います。CheMelonは、2025年に発表された「分子記述子を利用した教師あり事前学習モデル (descriptor-based pretraining model) 」です。
ケモインフォマティクス MMPA用のオープンソースWebアプリケーション【Matcher】
Matcher は、Merck社が公開しているオープンソースの MMPA（Matched Molecular Pair Analysis）用 Web アプリケーションです。Githubの記載に従って、Dockerを用いた環境構築を行います。